Material y Métodos
fiogf49gjkf0d fiogf49gjkf0d SISTEMA nosetiroides
El sistema desarrollado se denomina “nosetiroides”.Los requisitos impuestos para el sistema son los de eficacia, facilidad de uso y reusabilidad.
El sistema se estructura en varios módulos independientes e interconectados. Los principales módulos son: Base de conocimiento, Mecanismo de inferencia, Módulo de explicación y módulo de adquisición del conocimiento.
La Base de conocimiento (BC) la componen una base de datos, que incluye los rasgos y diagnósticos junto con sus definiciones, atributos y propiedades, y la base de reglas que vincula conjuntos de rasgos con diagnósticos con indicación de sus factores de certeza.
El Mecanismo de inferencia (MI) implementa el proceso de razonamiento que ejecuta el sistema en cada consulta y que aproxima, en cierta medida, el proceso de razonamiento que sigue un citólogo en el desarrollo de su trabajo. En esencia, a cada diagnóstico asigna un grado de certeza en función de los coeficientes de cada rasgo introducido como entrada y de los factores de certeza que vinculan rasgos con diagnósticos. Conforme se aportan datos, se van actualizando los valores de certeza de los diagnósticos y la respuesta final es una lista de diagnósticos ordenados (decrecientemente) según estos valores de certeza. Este mecanismo de inferencia es independiente de la base de conocimiento, para facilitar su reemplazamiento o modificación.
La tarea del Módulo de explicación (ME) es proporcionar aclaraciones al usuario del camino seguido para alcanzar las conclusiones que se le presentan.
El Módulo de adquisición del conocimiento (MAC) se compone de un interfaz amigable que facilita la adición, modificación o eliminación de rasgos y diagnósticos, así como de reglas que los vinculan. Este es el módulo que servirá de interfaz a todos los expertos que quieran colaborar en nuestro proyecto. Las aportaciones que realicen serán consensuadas para elaborar una base de conocimiento con amplio consenso. Solicitamos, por tanto, la colaboración de todos los expertos en el área. El sistema libremente disponible a través del URL https://bahia.ugr.es/nosetiroides.
Como se ha indicado se pretende que el sistema sea eficaz. Debe reproducir lo más certeramente posible el comportamiento de un citólogo en su diagnóstico, para que así pueda constituir una una herramienta útil para el profesional citólogo. Parte importante para lograr esta eficacia es que el conocimiento del sistema sea revisado y completado con asidudidad, para que esté actualizado.
Con el objetivo de hacerlo accesible al mayor número posible de interesados se ha planteado como una aplicación web, disponible desde cualquier dispositivo (ordenador, PDA, teléfono móvil WAP, …) que se pueda conectar a Internet.
Para lograr la facilidad de uso se persigue el uso de interfaces de usuario simples e intuitivas. Deben satisfacer los requisitos establecidos por los criterios de ergonomía. La información debe presentarse/requerirse a través de ventanas atractivas que estimulen el uso del sistema. Una característica distintiva de este sistema es que la captación de datos se hace, fundamentalmente, a través de imágenes en lugar de en forma de texto o valores numéricos.
En relación con la mantenibilidad se impone crear un sistema bien estructurado, que facilite la depuración y extensión de funcionalidades.
Los datos de la Base de conocimiento se estructuran en Diagnósticos y Rasgos.
DIAGNÓSTICOS
CONSTRUCTO:
Característica bipolar de cada elemento en relación a cada diagnóstico |
Para construir su base de datos se ha recurrido a la literatura10,12,13,14,15,16. A partir de la misma se han establecido 13 diagnósticos, que son los siguientes.
D1 .-Quiste
D2.-Hiperplasia difusa tóxica (enf. De Graves)
D3.- Nódulo coloideo
D4.-Nódulo adenomatoideo
D5.- Proliferación folicular
D6.- Tumor de células de Hürthle
D7.- Tiroiditis de Quervain
D8.- Tiroiditis de Hashimoto
D9.- Carcinoma papilar
D10.- Carcinoma medular
D11.- Carcinoma anaplásico
D12.- Linfoma
D13.- Metástasis
Se han sintetizado las descripciones efectuadas por los distintos autores para cada diagnóstico.
A partir de estas descripciones se ha elaborado un conjunto de “rasgos”, que han sido catalogados por algunos de los autores dándoles un peso según la importancia estimada para cada diagnóstico.
ELICITACIÓN DEL CONOCIMIENTO
Hay que resolver dos cuestiones: 1ª) Traducir los rasgos al lenguaje asimilable por el ordenador. 2ª) Transferir el “conocimiento” implícito en los rasgos de forma cuantificada.
Para que las descripciones citológicas sean asimilables por el ordenador, cada cada RASGO se ha descompuesto en:
RASGO = COMPONENTE + CALIFICADOR + CARACTERÍSTICA
Los COMPONENTES de los rasgos pueden ser: Coloide, Fondo o Celularidad
El CALIFICADOR es un componente del rasgo que es imprescindible para representar al componente. Por ejemplo, Coloide abundante o Fondo inflamatorio. No obstante, hay algunos calificadores que precisan ser explicitados mediante lo que hemos denominado CARACTERÍSTICA. Así, el aspecto del coloide tiene que ser definido (“viscoso, en pequeños acúmulos…”) o el aspecto celular (“homogéneo o polimorfo…”). En cuanto al CALIFICADOR “tipo celular”, está representado por un número de características, correspondiendo cada una de ellas a un tipo celular. Cada tipo celular a su vez, se comporta como un RASGO constituido por un COMPONENTE (por ej.células foliculares) + un CALIFICADOR (por ej.cantidad) y una CARACTERÍSTICA (por ej. escasa).
En la TABLA 1 se exponen para cada COMPONENTE los CALIFICADORES y en su caso, para cada CALIFICADOR sus CARACTERÍSTICAS así como las CARACTERÍSTICAS de los CALIFICADORES del Tipo celular (TABLA 1C-1G)
TABLA 1A:
RASGO = COMPONENTE + CALIFICADOR + CARACTERÍSTICA |
COMPONENTE:
COLOIDE( C)
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COMPONENTE:
FONDO (F)
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COMPONENTE:
CELULARIDAD (CE)
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CALIFICADOR Coloide( C)
-Abundante (C1)
-Escaso (C2)
-Ausente (C3)
-Sin especificar (C4)
-ASPECTO DEL COLOIDE (ASPCOL)
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CALIFICADOR Fondo (F)
-Hemorrágico (F1)
-Limpio (F2)
-Diatésico o Necrótico (F3)
-Inflamatorio (F4)
-Cristales (F5)
-Cuerpos de psamoma presentes (F6)
-Cuerpos de psamoma ausentes (F7)
-Amiloide (F8)
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CALIFICADOR Celularidad (CE)
-Abundante (CE1)
-Escasa (CE2)
-Sin especificar (CE4)
-Ausente (CE3)
-ASPECTO CELULAR (ASPCEL)
-TIPO CELULAR (TC)
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CARACTERÍSTICA Coloide
-Viscoso, en “goma de mascar” (ASPCOL1)
-Grandes acúmulos de coloide (ASPCOL2)
-Acúmulos pequeños (“bolas”) (ASPCOL3)
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CARACTERÍSTICA Celularidad
TIPO CELULAR (TC)
-Células foliculares (TC1)
-Células oncocíticas (TC2)
-Células sanguíneas (TC3)
-Polinucleares (TC4)
-Histiocitos (TC5)
-Células linfoides (TC6)
-Células de aspecto plasmacitoide (TC7)
-Células de aspecto fusiforme (TC8)
-Células de aspecto poligonal (TC9)
-Células gigantes (TC10)
-Células escamosas (TC11)
-Células mucinosas (TC12)
-Células ciliadas (TC13)
-Células malignas (TC14)
-Ausencia de c. malignas (TC15)
-Células sin identificar (TC16)
-Células epitelioides (TC17)
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CARACTERÍSTICA Celularidad
ASPECTO CELULAR (ASPCEL)
-ASPECTO CELULAR HOMOGÉNEO (ASPCEL1)
-ASPECTO CELULAR POLIMORFO (ASPCEL2)
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TABLA1B:
CALIFICADORES DEL TIPO CELULAR
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TAMAÑO (TAM)
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CANTIDAD (CAN)
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AGRUPACIÓN (AG)
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CITOPLASMA (CI)
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NUCLEO (NU)
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TABLA 1C:
CARACTERÍSTICAS DEL TAMAÑO (TAM)
DEL TIPO CELULAR |
-Grande (TAM1)
-Pequeño (TAM2)
-Gigante (TAM3)
-Sin especificar (TAM4) |
TABLA 1D:
CARACTERÍSTICAS DE CANTIDAD (CAN)
DEL TIPO CELULAR |
-Abundante (CAN1)
-Escasa (CAN2)
-Ausente (CAN3)
-Sin especificar (CAN4)
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TABLA 1E:
CARACTERÍSTICAS DE AGRUPACIÓN (AG)
DEL TIPO CELULAR |
-Células aisladas (AG1)
-Grupos pequeños (AG21)
-Grupos intermedios (AG22)
-Láminas (AG23)
-Monocapa (AG24)
-Tridimensionales (AG25)
-Papiliformes (AG26)
-Disposición microfolicular (AG27)
-Disposición microfolicular con coloide en su interior (AG28)
-Disposición macrofolicular (AG29)
-Disposición macrofolicular con coloide en su interior (AG210)
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TABLA 1F:
CARACTERÍSTICAS DEL CITOPLASMA (CI)
DEL TIPO CELULAR |
-Anisocitosis, Pleomorfismo ( CI1)
-Monomorfismo (CI2)
-Citoplasma aumentado (CI3)
-Citoplasma “ en llama” (CI4)
-Vacuolas citoplasmáticas (CI5)
-Gránulos citoplasmáticos (CI6)
-Agregados linfohistiocitarios (CI7)
-Cuerpos linfoglandulares (CI8)
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TABLA 1G:
CARACTERÍSTICAS DEL NUCLEO (NU) DEL TIPO CELULAR |
-Normal (NU1)
-Núcleo oval (NU2)
-Núcleo redondeado (NU3)
-Núcleo irregular (NU4)
-Cromatina grosera (NU5)
-Cromatina fina (NU6)
-Cromatina “en sal y pimienta” (NU7)
-Hipercromatismo nuclear (NU8)
-Hipertrofia nuclear (NU9)
-Nucleolo prominente (NU10)
-Nucleolo inconspicuo (NU11)
-Binucleación (NU12)
-Multinucleación (NU13)
-Atipia nuclear (NU14)
-Anisocariosis (NU15)
-Pseudoinclusiones nucleares (NU16)
Hendiduras nucleares (NU17)
Mitosis(NU18)
Mitosis atípica (NU19)
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A continuación se ofrece un listado de los COMPONENTES, CALIFICADORES Y CARACTERÍSTICAS de que disponemos para definir los RASGOS
RASGO = COMPONENTE + CALIFICADOR + CARACTERÍSTICA
COMPONENTE:
Coloide ( C)
Fondo (F)
Celularidad (CE)
CALIFICADOR:
Coloide Abundante (C1)
Coloide Escaso (C2)
Coloide Ausente (C3)
Coloide Sin especificar (C4)
ASPECTO DEL COLOIDE (ASPCOL)
Fondo Hemorrágico (F1)
Fondo Limpio (F2)
Fondo Diatésico o Necrótico (F3)
Fondo Inflamatorio (F4)
Fondo : Cristales (F5)
Fondo : Cuerpos de psamoma presentes (F6)
Fondo : Cuerpos de psamoma ausentes (F7)
Fondo : Amiloide (F8)
Celularidad Abundante (CE1)
Celularidad Escasa (CE2)
Celularidad Sin especificar (CE4)
Celularidad Ausente (CE3)
ASPECTO CELULAR (ASPCEL)
TIPO CELULAR (TC)
CARACTERÍSTICA
Aspecto del coloide (ASPCOL)
R5:Viscoso, en “goma de mascar” (ASPCOL1)
R6:Grandes acúmulos de coloide(ASPCOL2)
R7:Acúmulos pequeños (“bolas”) (ASPCOL3)
ASPECTO CELULAR (ASPCEL)
Predomina un tipo celular (ASPECTO CELULAR HOMOGÉNEO) (ASPCEL1)
Celularidad polimorfa (ASPECTO CELULAR POLIMORFO) (ASPCEL2)
Tipo celular (TC)
Células foliculares (TC1)
Células oncocíticas (TC2)
Células sanguíneas (TC3)
Polinucleares (TC4)
Histiocitos (TC5)
Células linfoides (TC6)
Células de aspecto plasmacitoide (TC7)
Células de aspecto fusiforme (TC8)
Células de aspecto poligonal (TC9)
Células gigantes (TC10)
Células escamosas (TC11)
Células mucinosas (TC12)
Células ciliadas (TC13)
Células malignas (TC14)
Ausencia de c. malignas (TC15)
Células sin identificar (TC16)
Células epitelioides (TC17)
TIPO CELULAR: CALIFICADOR:
TAMAÑO (TAM)
CANTIDAD (CAN
AGRUPACIÓN (AG)
NUCLEO (NU)
CITOPLASMA (CI)
TIPO CELULAR: CARACTERÍSTICA:
TAMAÑO (TAM)
Grande (TAM1)
Pequeño (TAM2)
Gigante (TAM3)
Sin especificar (TAM4)
CANTIDAD (CAN)
Abundante(CAN1)
Escasa (CAN2)
Ausente(CAN3)
Sin especificar (CAN4)
AGRUPACIÓN (AG)
Células aisladas (AG1)
Grupos (AG2)
Grupos pequeños (AG21)
Grupos intermedios (AG22)
Láminas (AG23)
Monocapa (AG24)
Tridimensionales (AG25)
Papiliformes (AG26)
Disposición microfolicular (AG27)
Disposición microfolicular con coloide en su interior (AG28)
Disposición macrofolicular (AG29)
Disposición macrofolicular con coloide en su interior (AG210)
NUCLEO (NU)
Normal (NU1)
Núcleo oval (NU2)
Núcleo redondeado (NU3)
Núcleo irregular (NU4)
Cromatina grosera (NU5)
Cromatina fina (NU6)
Cromatina “en sal y pimienta” (NU7)
Hipercromatismo nuclear (NU8)
Hipertrofia nuclear (NU9)
Nucleolo prominente (NU10)
Nucleolo inconspicuo (NU11)
Binucleación (NU12)
Multinucleación (NU13)
Atipia nuclear (NU14)
Anisocariosis (NU15)
Pseudoinclusiones nucleares (NU16)
Hendiduras nucleares (NU17)
Mitosis(NU18)
Mitosis atípica (NU19)
CITOPLASMA (CI)
Anisocitosis,Pleomorfismo ( CI1)
Monomorfismo (CI2)
Citoplasma aumentado (CI3)
Citoplasma “en llama” (CI4)
Vacuolas citoplasmáticas (CI5)
Gránulos citoplasmáticos (CI6)
Agregados linfohistiocitarios (CI7)
Cuerpos linfoglandulares (CI8)
Para “cuantificar” el conocimiento, se le ha de dar un valor a cada rasgo. Para ello se ha tomado como modelo la herramienta confeccionada por Paramá y cols.9, y se han elaborado “constructos”. Cada constructo corresponde a uno de los diagnósticos seleccionados, y el valor bipolar significa que un rasgo tenga importancia para cada diagnóstico o no (FIGURA 1).
fiogf49gjkf0dEl "dominio" está constituido por los diagnósticos a que se puede llegar con la punción de l tiroides. Los "elementos" son los rasgos citológicos, y los "constructos" se elaboran para cada diagnóstico en relación con cada uno de los rasgos.">
FIGURA 1 - fiogf49gjkf0d El "dominio" está constituido por los diagnósticos a que se puede llegar con la punción de l tiroides. Los "elementos" son los rasgos citológicos, y los "constructos" se elaboran para cada diagnóstico en relación con cada uno de los rasgos.
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