Los estudios de la expresión génica a nivel proteico se están demostrando como fundamentales a la hora de poner en relación genotipo con fenotipo celular.

Recientes avances tecnológicos en el campo de la proteómica, tales como la microdisección de tejidos, electroforesis de proteínas (electroforesis 2D y capilar), caracterización microquímica mediante espectrometría de masas (MALDI, -MS, -TOF...), y el desarrollo de nuevas herramientas informáticas para el procesado de la información y consulta remota de bases de datos de secuencias proteicas ya conocidas, están abriendo nuevas vías de investigación que permitirán mejorar el conocimiento de los mecanismos fundamentales del desarrollo tumoral, así como encontrar nuevas estrategias en su tratamiento mediante vacunas antigénicas, nuevas dianas a agentes quimioterápicos o nuevos marcadores de detección tumoral precoz.

Son escasos hasta el momento los estudios realizados sobre proteómica de tejidos normales humanos y sus lesiones neoplásicas asociadas, habiéndose centrado hasta el momento en neoplasias de vejiga, carcinomas de colon. Existen además otras publicaciones aisladas sobre células epiteliales y mioepiteliales de mama, hepatocitos, cáncer de próstata, lavados broncoalveolares, plaquetas o líneas celulares linfoblásticas, BEAS2B y A549.

Hemos identificación, mediante electroforesis SDS-PAGE y/o 2DE de tejidos de tumores primarios de pulmón, los distintos perfiles fenotípicos proteicos y comparado las diferencias cualitativas y/o cuantitativas entre los tejidos pulmonares normales y sus neoplasias asociadas. Hasta el momento se han caracterizado 21 manchas (spots) proteicas de interés El estudio está siendo realizado en muestras recogidas en el Servicio de Anatomía Patológica del Hospital General Universitario Gregorio Marañón procedentes de resecciones quirúrgicas de pulmones neoplásicos. Los tumores son tallados para eliminar tejido no tumoral y cortados en criostato alternativamente en secciones finas para estudios histopatológicos y gruesas para estudios proteómicos. Cada muestra tumoral es pareada a una muestra de tejido normal y una muestra de tejido peritumoral del mismo órgano que son procesadas de forma idéntica. Simultáneamente también se está realizando un estudio histopatológico de rutina de las muestras (hematoxilina/eosina, PAS, Van Gieson, Reticulina, Azan, Gallego ....).