F. Martín-Sánchez¹, G. Bueno², O. Coltell³, D. Corella⁴, J. Díaz⁵, J. A. Heredia⁶, V. LOPEZ¹, Mª I. Loza⁷, N. Malats⁸, V. Maojo⁹, X. Pastor¹⁰, A. Pazos¹¹, M. Robles ¹², F. Sanz ¹³.

1Area de Bioinformática y Salud Pública. Instituto de Salud Carlos III. 28220-Majadahonda.
²Departamento de Ingeniería Eléctrica, Electrónica y Automática. Universidad Castilla-La Mancha. Ciudad Real.
³Grupo de Integración y Re-Ingeniería de Sistemas (IRIS). Departamento de Lenguajes y Sistemas Informáticos. Universidad Jaume I. Castellón.
⁴Unidad de investigación en Epidemiología Genómica y Molecular. Departamento de Medicina preventiva Facultad de Medicina. Universidad de Valencia.
⁵Servicio de Informática. Hospital Universitario Virgen de las Nieves. Granada.
⁶Departamento de Tecnología Escuela de Ingeniería Informática. Universidad Jaume I. Castellón.
⁷Unidad de Farmacogenómica Aplicada a I+D de Fármacos. Departamento de Farmacología. Facultad de Farmacia. Universidad de Santiago de Compostela.
⁸Grupo de Investigación en Epidemiología Clínica y Molecular del Cáncer. Instituto Municipal de Investigación Médica. Barcelona.
⁹Departamento de Inteligencia Artificial. Facultad de Informática. Universidad Politécnica de Madrid.
¹⁰Unidad de Informática Médica. Corporación Sanitaria Cliníc. Barcelona.
¹¹Facultad de Informática. Universidad de Coruña.
¹²Grupo BET-Informática Médica. Facultad de Informática. Universidad Politécnica de Valencia.
¹³Unidad de Investigación en Informática Biomédica (GRIB). Instituto Municipal de Investigación Médica(IMIM). UPF. Barcelona.

La comunidad biomédica se encuentra con la necesidad de procesar una gran cantidad de datos en los distintos niveles de información sobre salud (población, enfermedad, paciente, órgano o tejido y molecular o genético). La investigación de enfermedades complejas, multigénicas y de alta influencia de factores ambientales necesita de acciones integradas entre distintas especialidades que ayuden al estudio de las interacciones entre todos los distintos niveles de información. Desde un punto de vista clásico la Informática en Salud Pública ha sido capaz de enfrentarse y resolver problemas a nivel poblacional; las aplicaciones de la Informática Médica han manejado eficazmente los niveles tanto de la enfermedad como del paciente, y las disciplinas de procesamiento de imágenes médicas han desarrollado herramientas de gestión y análisis de imágenes en la realización de técnicas no invasivas para el estudio de órganos y tejidos. Por otro lado, otra fuente de conocimiento cada vez más abundante es aquella que afecta a los niveles molecular y genético, en este sentido ha sido la Bioinformática la proveedora de herramientas para la gestión y análisis de los datos disponibles.

La Informática Biomédica [1] desempeñará un papel preponderante en la integración de estos nuevos datos y estos nuevos enfoques a la hora de realizar sus aplicaciones sanitarias. La Red de Informática Biomédica INBIOMED [2] es una consecuencia del desarrollo de nuevos enfoques y nuevas tecnologías ante la necesidad creciente de sistemas capaces de almacenar, relacionar y gestionar todos los datos y la información en biomedicina, así como de desarrollar herramientas de análisis que permitan generar, predecir, modelizar y visualizar conocimiento biomédico a partir de los datos experimentales.

Los objetivos de la Red INBIOMED pueden brevemente concretarse en:

Esta Red supone un avance hacia lo que se ha denominado próxima revolución en Internet (la web semántica) por la decidida apuesta por gestionar conocimiento en los diversos nodos de la Red.

La Red INBIOMED está coordinada por el Área de Bioinformática y Salud Pública del Instituto de Salud Carlos III. Su organización tiene un carácter cooperativo, donde se pretende compartir datos y recursos entre los grupos participantes. El trasvase y utilización de información entre los distintos grupos que integran la Red precisa de protocolos homogéneos y estandarizados de recogida, integración, almacenamiento y procesamiento de datos. Todos los documentos generados, explicando la arquitectura y los desarrollos efectuados, están a disposición de toda la Red en un portal interno para trabajo colaborativo.

La Red INBIOMED esta constituida por nueve comités de trabajo como se muestra en la Figura 1.

Figura 1. Organización de los comités de trabajo de la Red Temática INBIOMED.

Comité de Comunicación. Encargado de la difusión de las actividades y logros realizados por INBIOMED (Creación y mantenimiento de la página web, Boletín electrónico bimensual, organización de Jornadas de divulgación científica, artículos científicos, prensa...).

Comité de Formación en Informática Biomédica. Durante todo el desarrollo de la Red se realizaran actividades de formación continuada de investigadores mediante participación en seminarios, sesiones y otras actividades abiertas y específicas desarrolladas por los grupos integrantes de INBIOMED. Se pretende también realizar una caracterización de la Informática Biomédica, así como desarrollar planes de formación en esta especialidad.

Comité de Calidad, Seguridad y Ética. Todas las actividades de la Red estarán contempladas en el marco del aseguramiento de la calidad permitiendo reducir, eliminar y prevenir las deficiencias de calidad de los productos a obtener y alcanzar una razonable confianza en las prestaciones y servicios esperados por el usuario

Se está elaborando un Manual de Gestión de Calidad de la Red definiendo la Misión, Visión, Política y Objetivos, así como un compendio de los objetivos particulares de cada uno de los comités que componen INBIOMED.

Comité de Plataformas tecnológicas. Está desarrollando un prototipo operativo que permitirá a la Red centrarse en el perfeccionamiento del modelo de integración y en desarrollar un modelo de información común. Este prototipo es un almacén de datos federado a través de servicios web, arquitectura que combina las ventajas de las bases de datos federadas y de los almacenes de datos, permitiendo la estandarización de las comunicaciones a través de servicios web. Con esta arquitectura cada grupo de investigación mantiene un absoluto control sobre sus propios datos y aplicaciones -pudiendo utilizar el sistema de forma independiente-, pero si desea puede dejar aquellos que estime conveniente a disposición de cualquier otro miembro autorizado.

Comité de Integración de Bases de Datos y Representación del Conocimiento. Generará el modelo de datos general que permitirá representar información biomédica a distintos niveles. Para ello INBIOMED está identificando y seleccionando las posibles fuentes de datos utilizados por los grupos de usuarios para construcción de una ontología como marco terminológico de referencia.

Comité de Procesamiento y Análisis de Datos Estructurados. En el ámbito de las herramientas de procesamiento y análisis de datos es muy importante el avance en el diseño y desarrollo de sistemas de ayuda a la decisión clínica y en la aplicación de técnicas de minería de datos a partir del estudio de la naturaleza de los datos manejados por los grupos clínicos de la Red y las bases de datos que los contienen.

Comité de Modelización y Simulación. La Red centra sus esfuerzos también en definir y desarrollar herramientas de análisis que permitan modelizar, visualizar y predecir conocimiento biomédico a partir de datos clínicos, genéticos y epidemiológicos.

Comité de Procesamiento y Análisis de Imágenes. Estudia los diversos tipos de imágenes biomédicas con las que trabajan los grupos clínicos diseñando futuros tratamientos para esas imágenes, los datos asociados a ellas para su comprensión, los dispositivos empleados para su obtención y el contexto en el que se sitúan (farmacología, patología, etc). Se tomaran decisiones relativas al uso y adaptación de diversos estándares de almacenamiento de imágenes (DICOM, etc...) y del software de procesado y de gestión con el objetivo de incorporarlo en la plataforma INBIOMED.

Comités de usuarios: Epidemiología-Cáncer, Epidemiología Genómica-Cardiovascular y Farmacogenética-Neuropsiquiatría. El objetivo de INBIOMED es aplicar y monitorizar la plataforma de integración de datos en estudios pertenecientes a estas tres disciplinas (farmacogenética, epidemiología genética y diagnóstico molecular basado en la imagen) en los ámbitos de las patologías más prevalentes (cáncer, cardiovascular, neurológica), con la finalidad de poder ser aplicado, en el futuro, al estudio de cualquier patología. Estos comités de usuarios conjuntamente deben identificar y consensuar las necesidades informáticas comunes a las tres líneas de investigación.

La Red INBIOMED está trabajando en el ámbito tecnológico en el desarrollo de arquitecturas y herramientas de integración de datos biomédicos, en el campo científico en el desarrollo de modelos, técnicas, artículos, ponencias, y en relación a nuevos conocimientos en el desarrollo de planes de formación en Informática Biomédica.

Las actividades de la Red INBIOMED que abordarán los grupos tecnológicos son la puesta a punto de soluciones desarrolladas en el campo de las Bases de Datos y sus infraestructuras asociadas (servidores, servicios, interconexión), los grupos de Informática Biomédica se encargarán del modelado y representación de los tipos de datos a manejar así como de la implementación de soluciones de análisis y de minería de datos y los grupos de investigación de patologías, grupo de usuarios finales, proporcionaran los requisitos específicos para realizar el seguimiento y validación de la plataforma.

La Red Temática de Investigación INBIOMED (Código G03/160) está financiada por el Fondo de Investigaciones Sanitarias (FIS) del Instituto de Salud Carlos III.