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CGH en tumores neuroectodérmicos primitivos (PNETs) del sistema nervioso central

INTRODUCCIÓN
Los PNET supratentoriales (sPNETs) son similares morfológicamente a los infratentoriales o meduloblastomas (MBs), pero muestran diferente comportamiento biológico, siendo, los sPNETs más agresivos.
Ante la sospecha de que estos tumores presenten diferencias genéticas entre sí, hemos sometido a ambos a un estudio de CGH, a fin de determinar los loci que sufren amplificación o deleción a nivel de todo el genoma.
MATERIAL Y MÉTODOS
Se estudiaron mediante CGH 20 muestras de tumores frescos congelados (14 MBs, 6 sPNETs).
RESULTADOS
La alteración más frecuente en los MBs fue la pérdida de 17p (50%) normalmente asociada a la ganancia en 17q (36%). No se encontró esta alteración en los sPNETs.
La alteración más frecuentemente encontrada en los sPNETs fue la ganancia de 1q (4/6).
En ambos tipos de tumores se encontró frecuentemente la pérdida de 16p (4/14 MBs y 3/6 sPNETs). La pérdida de 16q fue encontrada en 5/14 de los MBs y en un caso de sPNET.
La pérdida de 10q de detectó en 6/14 MBs, pero no se encontró en ningún sPNET.
Dos casos de MBs presentaron una pequeña amplificación en 4q12.
CONCLUSIONES
Existen alteraciones comunes a ambos grupos (sPNETs y MBs) como la ganancia de 1q, o la pérdida de 16p. En MBs la pérdida de 17p se asocia a la ganancia de 17q, lo cual hace sospechar la presencia de isocromosoma 17q en MB, pero no se ha encontrado dicha alteración en los sPNETs.
Dos casos de MB presentan amplificación en 4q12. En esta región se encuentra, entre otros, el oncogén c-kit, alterado en leucemias. Ante la sospecha de que pudiera tratarse de una amplificación de este gen, se realizó un estudio mediante FISH con una sonda específica para dicho gen en las muestras amplificadas. No se encontró amplificación de dicho gen.

Los tumores primitivos neuroectodérmicos (PNETs) son tumores embrionarios invasivos de grado IV de malignidad. Los PNETs del Sistema Nervioso Central pueden ser tanto supratentoriales (sPNETs) como infratentoriales.
Los sPNETs son similares morfológicamente a los infratentoriales o meduloblastomas (MBs) que se localizan en el cerebelo, pero muestran diferente comportamiento biológico, siendo, los sPNETs más agresivos que los MBs.
Ante la sospecha de que estos tumores presenten diferencias genéticas específicas de grupo, se ha estudiado ambos tipos de tumores mediante CGH, a fin de determinar los loci que sufren amplificación o deleción a nivel de todo el genoma.

Se estudiaron mediante CGH 20 muestras de tumores frescos congelados (14 de MBs y 6 sPNETs).
Se digirió el DNA genómico previamente extraído por métodos convencionales con TruI1 y se marcó mediante random priming con ChromatideTM AlexaFluor® 488-5-dUTP (DNA problema) o ChromatideTM AlexaFluor® 594-5-dUTP (DNA control). Se coprecipitaron y desnaturalizaron los DNAs y se hibridaron sobre metafases normales previamente desnaturalizadas durante 72 h a 37ºC en cámara húmeda. Se lavaron los portas y se contrastaron con DAPI/Vectashield. Las preparaciones fueron observadas en un microscopio de epifluorescencia y se capturaron al menos 12 metafases para cada caso que fueron ordenadas y analizadas mediante un software específico.

La alteración más frecuente en los MBs fue la pérdida de 17p (50%) normalmente asociada a la ganancia en 17q (36%). No se encontró esta alteración en los sPNETs (figura 1 y 2).
La alteración más frecuentemente encontrada en los sPNETs fue la ganancia de 1q (4/6).
En ambos tipos de tumores se encontró frecuentemente la pérdida de 16p (4/14 MBs y 3/6 sPNETs). La pérdida de 16q fue encontrada en 5/14 de los MBs y en un caso de sPNET.
La pérdida de 10q fue encontrada en 6/14 MBs, pero no se encontró en ningún sPNET.
Dos casos de MBs presentaron una pequeña amplificación en 4q12 (figura 3).

Existen alteraciones comunes a ambos grupos (sPNETs y MBs) como la ganancia de 1q, o la pérdida de 16p. En MBs la pérdida de 17p se asocia a la ganancia de 17q, lo cual hace sospechar la presencia de isocromomoma 17q (i(17q)) en MB, pero no se ha encontrado dicha alteración en los sPNETs. Estos datos están en acuerdo con lo encontrado por otros autores.
Dos casos de MB presentan amplificación en 4q12 (figura 3). Sería interesante estudiar dicha región en busca de un oncogen que se encuentre amplificado en estos tumores. En esta región se encuentra, entre otros genes, el gen c-kit que se ha visto alterado en leucemias. Ante la sospecha de que pudiera tratarse de una amplificación de este gen, se realizó un estudio mediante FISH con una sonda específica para dicho gen en las muestras amplificadas. No se encontró amplificación de dicho gen.

1. Avet-Loiseau, H., et al., Comparative genomic hybridization detects many recurrent imbalances in central nervous system primitive neuroectodermal tumours in children. Br J Cancer, 1999. 79(11-12): p. 1843-7.
2. Gilhuis, H.J., et al., Comparative genomic hybridization of medulloblastomas and clinical relevance: eleven new cases and a review of the literature. Clin Neurol Neurosurg, 2000. 102(4): p. 203-209.
3. Jay, V., et al., Oncogene amplification in medulloblastoma: analysis of a case by comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization. Pathology, 1999. 31(4): p. 337-44.
4. Nicholson, J., et al., Imbalances of chromosome 17 in medulloblastomas determined by comparative genomic hybridisation and fluorescence in situ hybridisation. Mol Pathol, 2000. 53(6): p. 313-9.